Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD1Q9UIS9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms