Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHORDC1Q9UHD1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms