Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC10Q9NYD6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC10Q9NYD6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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