Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TREX1Q9NSU2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TREX1Q9NSU2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TREX1Q9NSU2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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