Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOMER3Q9NSC5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOMER3Q9NSC5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms