Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms