Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MED4Q9NPJ6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms