Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRHQ9HD43 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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