Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
REEP4Q9H6H4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms