Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms