Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF17Q9BXT8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms