Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BBS2Q9BXC9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms