Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms