Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC94Q9BW85 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms