Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TMEM43Q9BTV4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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TMEM43Q9BTV4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TMEM43Q9BTV4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TMEM43Q9BTV4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TMEM43Q9BTV4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TMEM43Q9BTV4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TMEM43Q9BTV4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TMEM43Q9BTV4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TMEM43Q9BTV4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TMEM43Q9BTV4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM43Q9BTV4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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