Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RHOXF2Q9BQY4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RHOXF2Q9BQY4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms