Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBBP8Q99708 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms