Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PITX2Q99697 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms