Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PKP4Q99569 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PKP4Q99569 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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