Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf72Q96LT7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf72Q96LT7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms