Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5RAP3Q96JB5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms