Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms