Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HGDQ93099 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HGDQ93099 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HGDQ93099 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HGDQ93099 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HGDQ93099 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HGDQ93099 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HGDQ93099 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HGDQ93099 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms