Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD35Q8N283 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms