Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q7L0L9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q7L0L9 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q7L0L9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q7L0L9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q7L0L9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q7L0L9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q7L0L9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q7L0L9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Q7L0L9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q7L0L9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q7L0L9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q7L0L9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q7L0L9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q7L0L9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms