Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TSSK4Q6SA08 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TSSK4Q6SA08 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms