Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms