Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms