Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FRMPD1Q5SYB0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FRMPD1Q5SYB0 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms