Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C10orf55Q5SWW7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms