Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RBM48Q5RL73 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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