Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ODF2Q5BJF6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms