Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RFTN2Q52LD8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RFTN2Q52LD8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms