Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TWISTNBQ3B726 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TWISTNBQ3B726 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms