Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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