Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms