Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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