Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK5Q16478 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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