Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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