Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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TRIP13Q15645 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIP13Q15645 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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