Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCOLCEQ15113 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCOLCEQ15113 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms