Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAM2Q15035 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms