Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ALCAMQ13740 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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