Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GPM6BQ13491 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms