Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
XRCC4Q13426 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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