Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGB3BPQ13352 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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