Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K1Q13233 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAP3K1Q13233 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms