Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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