Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXC1Q12948 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms