Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PTPN13Q12923 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PTPN13Q12923 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PTPN13Q12923 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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PTPN13Q12923 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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PTPN13Q12923 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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